Biomni 的 GEO 数据库公共数据挖掘实战演示
以前都不敢想这个事，给一个 GEO 公共数据库的编号，OmicOS 就能自动完成全套分析（前几天已测完 OmicOS）。
同样的问题，现在看看 Biomni 表现怎么样：“GSE162436 自动抓取这个 GEO 数据中的数据，并根据它的 metadata 和分组，进行数据分析”
发在 Science 的这个 Biomni 配上 Kimi k3 模型，相当不错，使用教程。它可以随意切换很多模型，非常方便（怎么用 Biomni，可以看这篇文章）。
基本上也是一口气全部跑完了，从数据下载到数据分析。后续如果想让它解读的话，其实还有一些是解读报告。我觉得如果找的数据比较多的话，甚至都可以让它自己去找一些相关的数据。比如说同领域的数据，让它自己下载，自己整合，估计也能发现一些规律。想数据挖掘的可以看看这个方向能不能发文章。因为现在 AI 找数据还是比较方便的，找得还很准，比自己在那里一个一个费劲读文献找数据好多了。
比如这个演示，我就让它自己查的 GEO 数据，然后它也能查到分组信息，自己也能理解该怎么组间比较，自己找相应的 metadata。
如果它找的数据够多的话，还真的能凑一篇文章。
这次做的都是 Bulk RNA-seq，下次测评单细胞数据、空间数据，还有基因组数据、蛋白质组等，看看它能不能实现 GEO 公共数据的自动下载、自动分析。
目前已经给大家装好的智能体包括如下（我们走的就是最简化用上的路线，均可点击即用）：
生信/生命科学领域智能体：Claude Science、Biomni、OmicOS、OpenScience
普适性智能体：Codex、Claude、Gemini、OpenClaw
Science | 生信分析太繁琐？斯坦福造了个全自动 AI 科研 Agent Biomni，不用敲代码直接用（这个我们也测试成功了，本地部署）
真牛，OpenScience 确实有碰 Claude Science 的实力，高难度生信分析实战展示；内置 290+ 科研 Skills
怪不得 Claude Science 那么好用，原来装了这 32 个科研 Skills
Claude Science 全面部署：科研人的 AI 工作台，正在把文献、代码、数据库、图表和服务器串到一起
实战展示：Claude Science 可不垃圾，用 DeepSeek 模型，做出来的也是一流水平
单细胞到底聚多少类，OmicOS 轻松搞定，从最佳聚类，到单细胞注释，一气呵成
使用教程，用 Codex 登录 OmicOS，聪明的大脑+绝佳的单细胞和空间等生信分析框架
今年最大的功能上新，全面部署，把单细胞/空间组学分析装进网页：OmicOS，让生信分析从“配环境”进入“点开就跑”时代——基于 OmicVerse
（我们自己开发的服务器，很多意想不到的功能
免💰服务器地址：https://vip.r-py.com/
）
我们计划开启四个免💰的服务器节点给大家使用，考虑到有些同学想跑大数据分析，所以我们这个是不限制使用的，多大数据都能加载。（账号和存储都是独立的，不用担心别人看到你的数据）；资源有限，大家分析完请及时清空和导出，以便让更多人使用。
怎么领服务器，可以查看：
很多代码也都放到免💰的公共共享服务器中了。
我们会逐步把测试好的代码，放到公共文件夹下，让大家无障碍运行，打开就能看到。
这篇 Nature 子刊把 RNA 速率拟时序分析利用到了极致，生信部分几乎都是用的这个分析。
很多代码都已经帮大家 debug，都可以顺利跑通；
如有服务器和生信培训学习需求问题，咨询下面 vx：
