OmicOS 的 GEO 数据库公共数据挖掘实战演示
发在 Science 的这个 Biomni 配上 Kimi k3 模型,相当不错,使用教程。它可以随意切换很多模型,非常方便(最近我们又上新的一个 AI 工具)
这可能是满足老板们需求的最简单的一种方式了:“你分析一下 GSE162436 这个数据。看看有没有差异”;
如果你之前没有接触过生信,这个时候你肯定会头大。想着怎么下数据?怎么分析这个数据?怎么解读?中间肯定有很多门槛。
现在好了,只需要给它一个公共数据编号,比如“GSE162436 自动抓取这个 GEO 数据中的数据,并根据它的 metadata 和分组,进行数据分析”,中间不需要有任何交互提醒,它会一口气给你跑到底,直接出图出结果。
这次给大家展示的是 OmicOS 的结果,下次给大家展示 Biomni 的。
如下是之前 OmicOS 的相关教程。
实战视频演示:现在 OmicOS 一句话搞定之前废了半天劲才安装成的 Monocle2 拟时序分析
单细胞到底聚多少类,OmicOS 轻松搞定,从最佳聚类,到单细胞注释,一气呵成
今年最大的功能上新,全面部署,把单细胞/空间组学分析装进网页:OmicOS,让生信分析从“配环境”进入“点开就跑”时代——基于 OmicVerse(不知道怎么用这个工具的,可以看这个)


目前已经给大家装好的智能体包括如下(我们走的就是最简化用上的路线,均可点击即用):
生信/生命科学领域智能体:Claude Science、Biomni、OmicOS、OpenScience
普适性智能体:Codex、Claude、Gemini、OpenClaw

Science | 生信分析太繁琐?斯坦福造了个全自动 AI 科研 Agent Biomni,不用敲代码直接用(这个我们也测试成功了,本地部署)
真牛,OpenScience 确实有碰 Claude Science 的实力,高难度生信分析实战展示;内置 290+ 科研 Skills
怪不得 Claude Science 那么好用,原来装了这 32 个科研 Skills
Claude Science 全面部署:科研人的 AI 工作台,正在把文献、代码、数据库、图表和服务器串到一起
实战展示:Claude Science 可不垃圾,用 DeepSeek 模型,做出来的也是一流水平
单细胞到底聚多少类,OmicOS 轻松搞定,从最佳聚类,到单细胞注释,一气呵成
使用教程,用 Codex 登录 OmicOS,聪明的大脑+绝佳的单细胞和空间等生信分析框架
今年最大的功能上新,全面部署,把单细胞/空间组学分析装进网页:OmicOS,让生信分析从“配环境”进入“点开就跑”时代——基于 OmicVerse
(我们自己开发的服务器,很多意想不到的功能
免💰服务器地址:https://vip.r-py.com/
)

我们计划开启四个免💰的服务器节点给大家使用,考虑到有些同学想跑大数据分析,所以我们这个是不限制使用的,多大数据都能加载。(账号和存储都是独立的,不用担心别人看到你的数据);资源有限,大家分析完请及时清空和导出,以便让更多人使用。

怎么领服务器,可以查看:
很多代码也都放到免💰的公共共享服务器中了。
我们会逐步把测试好的代码,放到公共文件夹下,让大家无障碍运行,打开就能看到。


这篇 Nature 子刊把 RNA 速率拟时序分析利用到了极致,生信部分几乎都是用的这个分析。
很多代码都已经帮大家 debug,都可以顺利跑通;
如有服务器和生信培训学习需求问题,咨询下面 vx:
