8.图像预处理（TR-NoiseX）

说明

1. 使用场景
2. 图像因为自荧光等因素造成背景噪声，影响细胞分割和表型分析，需要过滤背景噪声的场景。
3. 图像通道信息无法被qupath解析。
4. 配准过后，需要删除某些重复的通道。
5. 功能入口：菜单栏：Terrydr -> TR-NoiseX
6. 测试数据：demo-wsi/unfilter.ome.tif
7. 更详细的功能说明请查看

TR-NoiseX 图像预处理插件

操作步骤

自动过滤背景

● 以demo-wsi文件夹中的unfilter.ome.tif 图像为例，将该项目加入到项目中，并打开

● 切换为灰度图，查看DAPI通道的灰度图像

● 通过调整，可以看到DAPI通道背景存在噪音

● 打开NoiseX，自动带入当前查看的图像

● 执行自动背景过滤，等待提示后保存文件

● 新图像自动保存到原图同目录下，名称变为xxxx_norm

● 将新图像加入项目并查看对比

● 对比原图和新图像的背景

原图DAPI	自动过滤背景后

通道删除

● 打开NoiseX，点击删除通道按钮

● 选择要删除的通道，点击确定后，保存文件即可