6.空间分析(TR-Spa)
说明
- 使用场景
泰立瑞开发的Spa是QuPath的核心空间分析插件,专为解析组织微环境中的细胞空间关系而设计。它基于精确的细胞表型鉴定结果(通常由PhenoCluster插件生成),提供包括细胞邻域分析、共定位统计和空间分布热图在内的多种定量工具。该插件能够自动识别细胞间的聚集或排斥模式,并生成易于解读的结构化结果和图表展示,极大地提升了从复杂多重荧光图像中挖掘空间生物学洞察的效率,是研究肿瘤免疫微环境和细胞相互作用的重要工具。
功能入口:无, 在PhenoCluster运行之后,自动打开,注意:每次分析结束自动打开的网页不要刷新,刷新会丢失当前数据
测试数据:
a. 图像:桌面 demo-wsi/GCexample.ome.tif
b. 配置:Cluster
操作步骤
● 在PhenoCluster 运行完成后弹出的Spa界面就是空间分析
● 程序已经自动将分析的批注下的细胞数据上传
● 您可以根据自己需求调整参数查看各类分析
● 更详细的空间分析使用请查看


