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6.空间分析(TR-Spa)

说明

  1. 使用场景

泰立瑞开发的Spa是QuPath的核心空间分析插件,专为解析组织微环境中的细胞空间关系而设计。它基于精确的细胞表型鉴定结果(通常由PhenoCluster插件生成),提供包括细胞邻域分析、共定位统计和空间分布热图在内的多种定量工具。该插件能够自动识别细胞间的聚集或排斥模式,并生成易于解读的结构化结果和图表展示,极大地提升了从复杂多重荧光图像中挖掘空间生物学洞察的效率,是研究肿瘤免疫微环境和细胞相互作用的重要工具。

  1. 功能入口:无, 在PhenoCluster运行之后,自动打开,注意:每次分析结束自动打开的网页不要刷新,刷新会丢失当前数据

  2. 测试数据:

    a. 图像:桌面 demo-wsi/GCexample.ome.tif

    b. 配置:Cluster

操作步骤

● 在PhenoCluster 运行完成后弹出的Spa界面就是空间分析

● 程序已经自动将分析的批注下的细胞数据上传

● 您可以根据自己需求调整参数查看各类分析

● 更详细的空间分析使用请查看

TR-Spa泰立瑞空间生物学解决方案

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